モンストの回答詳細

まず編成ですが、進化ビリーをクシナダに変える事をオススメします。
クシナダの攻撃力がワンパンラインを越えていないとしても入れるべきだと思います。
理由は友情とSSです。
友情は貫通キャラはもちろんですが、反射キャラでも殴るよりもプラズマを引っ張ってグルグル回ってる方がダメージを稼げたりします。
SSは八雲1発でラストゲージが終わる事もあります。
毘沙門天はザコがワンパン出来る為、メテオの恩恵はあまり大きくありません。また、ヒーリングウォールが出る為、号令や自強化、反射変化や貫通変化などの動くSSの方が有効だと思います。

次に立ち回りです。
毘沙門天は制限ザコを残せば残すほど苦しくなります(ザコ1体につき5000以上の被ダメージ)。なので各ステージでの入りをターン調製しましょう。

具体的に言うと、
3ステージ目(謙信がいるステージ)は、進化ガブリエルからスタートする事を心掛けましょう。
そうすればクシナダのワンパンラインはそこまで大きな問題ではなくなります。

4ステージ目(進化前毘沙門天がいるステージ)は、貫通キャラからスタートしましょう。出来れば、前のステージをクシナダの攻撃で抜けると尚良いです。
そして、下段真ん中の反射制限と上段の反射制限のどちらかの2体を「必ず」倒しましょう。
下段真ん中の反射制限を倒せば次の反射キャラで貫通制限2体を倒しやすくなります。
制限ザコを倒しきる頃にはHPが少なくなっているはずなので、縦カン横カンで回復します。
毘沙門天だけになればクシナダのプラズマをメインに削ります。

5ステージ目は反射からスタートして、右下のゾンビを確実に倒す事。

ボス戦はどのステージも貫通キャラからのスタートを心掛けましょう。
何故なら、ザコの配置が貫通制限を2体倒すよりも反射制限を2体倒す方が簡単だからです。
また、こまめに回復も行いましょう。
私はHPが45000を割ったら必ず回復します。
危なくなったらクシナダ以外のSSはガンガン使いましょう。ラストゲージはクシナダのSSがあれば毘沙門天のHPを十分削りきれると思います。コツはクシナダと貫通キャラの間でプラズマを発生させるようにはじく事。
クシナダの大号令は殴りもですが、同時に発生するプラズマが強烈なので、クシナダと貫通キャラでプラズマを発生させて挟むとかなりダメージをかせげます。

毘沙門天はハートは出ませんが、必ずヒーリングウォールが出ます。
なので、HP管理とザコ処理をきっちりやればそれだけでかなり勝率が上がると思いますので、頑張って下さい。