降臨キャラは互換になりますか？

あえていうならガチャ限モンスターの互換として使える降臨はいません。

ナポレオン進化は聖騎士、アンチ重力バリア＆神キラー、ステータス良好、号令系ストライクショット、友情コンボ爆発。神化はマインスイーパーにゲージでアンチ重力バリア、攻撃特化なステータス、乱打系ストライクショット、友情コンボはメインが貫通拡散弾でサブに短距離拡散弾。
聖騎士は降臨にキラー持ちが現時点で存在しない種族だし進化はアンチ重力バリアと神キラーのダブルアビリティでイザナミとツクヨミの二つの超絶クエストに適性のある注目度の高いモンスターです。
それに加えて木属性クエストやダメージウォールの多いクエスト以外は安定して活躍できるほぼパーフェクトな存在です。私も出来ることなら手に入れたいモンスター。


現時点で水属性降臨の貫通タイプは沖田総司、オリガ、マリーアントワネットのみ。
マリーアントワネットはアンチ重力バリア持ちで神化は魔王キラーがゲージにつく亜人族。
沖田総司は進化がロボットキラーＬ、神化がロボットキラーとゲージにアンチダメージウォールなサムライ。
オリガは神キラーのみの魔王族。

一番近いのはアンチ重力バリア持ちのマリーアントワネットですが連れていくクエストによって互換性があるかは別の問題です。
貫通でハートやアイテムを安定してとりたいだけならマリーアントワネットで十分ですが評価の高い進化ナポレオンを連れていきたい超絶クエストに連れていけるかというと別だと思います。

ナポレオン進化のアンチ重力バリアと神キラーのタブルアビリティが主に注目される点ですが他の部分もほぼ非の付け所のないモンスターなので降臨モンスターに互換性は無いです。
代替案や妥協、下位互換としてなら降臨モンスターももちろん使えなく無いです。

降臨モンスターを貶しているように見えますが降臨には降臨のいいところがあるのでナポレオンの代わりではなく使いたい用途に使えるのかで考えてみてください。

運極を作ることが出来てクエストをクリアすれば誰でも入手できるという点を考慮すると努力すれば報われるのは降臨モンスターでしょう。

ガチャ限モンスターでの運極はほぼ作れる人はいないし、ガチャ運もあるかもしれませんがお金を出した分のオーブで手に入れた方もいるでしょう。 私はリセマラがあんまり好きな要素でないのでリセマラする場合は脇に置いときます。
ガチャ限モンスターは利用者に手に入れたいと思われてオーブを消費してもらうための要素の一つですので比べたらだめです。

水属性に絞るなら攻略を見ればすぐ調べられることなので調べられることは自分で調べた方が自分のためになりますよ。

最後にガチャ限モンスター１点狙いなら対象に含まれているかを確認の上、特定のものが出やすいとされているときに回した方がいいでしょう。
ナポレオンは限定なのでモンコレ以外には出ない(筈)なのでモンコレで対象になっている日に回した方が出ないとしてもマシでしょう。
私はナポレオン、ユグドラシル、徳川家康の対象日にナポレオンかユグドラシル狙いの単発引きで家康が出たので運が良ければ出ると思います。

降臨系の貫通タイプは非常に数が少ないため、中々代用になるモンスターはいません。
ナポレオンのどの点をフィーチャーするかによりますが、水・貫通・アンチ重力バリアという点なら新降臨のマリーアントワネットがいます。
魔王キラーという点を除けばあらゆる点においてナポレオンの劣化ですが、無課金入手できる貫通タイプとしてはそこそこ優秀な部類に入るのではないでしょうか。
他の候補も以下に挙げておきます。

水/AGB/爆発：ティーガーⅠ
水/貫通/神キラー：オリガ、斉藤一S（☆4-5）
水/神キラー/爆発：浦島太郎（☆4-5）

ナポレオン同等の性能はありません。

ＡＧＢもちだとマリーアントワネットぐらいですが神キラーはなくなります。

貫通タイプはどれも微妙なのでイザナミにおいては反射の神キラーＬ（ヨルムン、ぬらりひょん、紀伊）で代用する形になります。ツクヨミにおいてはいないので紀伊とセルケトで代用します
こんな感じでクリア可能です。

降臨においては、神は紀伊ですべてすむのでナポレオンは不要です。