覇者の塔37で起きたバグ(？)

普通の仕様ですよ。
古くはイザナミ(超絶)のボス1で全ゲージ飛ばしと一緒ですよ。
一瞬で大ダメージを出すと持ち越しされそのダメージ分残りのステージは短縮されます。

イザナミのボス1で飛ばしきらなかったらボス2で黄色ゲージ(最終ステージ)って事もあります。

ボスはあくまでも撤退であってボスのHPは最初から最後まで含めたHPで登場します。

ボス1(200万で撤退)+ボス2(300万で撤退)+ボス3(400万)だとすると最初から900万のHPで登場しています。
一瞬で900万を出せば全ゲージを飛ばしてステージクリアと成ります。

ちなみにゲージは飛んでも(青色→黄色)ステージは飛びません。

自分でゲージ飛ばしって言ってるのにバグとはこれ如何に

仕様ですね。はい。

そもそもなんでこれがバグだと思うのか分かりません

この質問は知らなかったから仕方ないですが、恥ずかしいので早めに閉じた方が良いですよ。

25階、中途半端なHPでアヴァロンのSSを打つとどうなりますか？わー！モンストはバグだらけだ！
ではなく、仕様です。ステージは飛ばされない、ということです。

アヴァロン所持してるのにゲージ飛ばしってわかんないの？

ステージ3のゲージまで飛ばしたって事ですね！繰越って思えば納得するのでは？

ゲージ飛ばしたのに中途半端に残すとそうなる「仕様」です。