ヤマタケ零にジョヤベルンを連れていく場合

個人的には神化推し

他のキャラの友情が発動しやすい
ハート取りやすい
ニードル事故起こりにくい
キラー付きエナサーで道中の鬼処理しやすい

などのメリットがあります。

貫通の神化の方が良いです。ニードル踏んでも何度も踏むことがないので気にせず弾けるし、味方の友情を最大限に生かせます。進化は鈍足反射で動きはかなり制約されますし、SSのダメージは安定してますが動かないのでそれだけですし、スピ爆のダメージが極小ですが自身が受けなければ無意味。
自分は最終的に神化ジョヤ・進化ジョヤ・シャンバラ・ゼウスで極めましたが、進化積んだのは伝染霧対策に過ぎません。

両方ですね。
自分はサブ機使ってるのもありますが、進化・神化除夜、シャンバラ、蔵馬が一番安定してます。

道中はどのキャラも友情が強いので多少ニードル踏んでも友情出してたら簡単にボス戦まで行けます。

自分は神化を使って運極にしました。
貫通なので、動きやすく、ニードル事故が少なく、鬼にキラーが乗り、神蔵馬がいる場合は神蔵馬との相性が抜群です。

パーティー編成によります。

例えば強友情を積んでいく場合は神化がオススメです。
貫通なので友情を出しやすく、ハートも確実に取れるのでサポートができます。特に貫通、MS、爆発SSなのでマーリンとの相性がいいですね。

逆に、強友情をあまり積まない場合は、進化が強いです。ボスに対しては友情・SSともに神化より火力を出せます。

運2で行く場合は進・神の両方入れています。

神化で周回してます。
貫通なので蔵馬等の友情を発動しやすいし、ハートを取りに行ったりニードル事故も起こりにくいのでオススメです。