どちらのアカウントを残すべきか教えて欲しいです。

今の垢かさらにリセマラしてカヲルシファーを狙うか

エース級のキャラが旧垢には少ないようなので
アリス龍馬の今の垢が良いと思います。
また、ヘラでイザナミ討伐から龍馬ナミベトベン神化でクシナダを楽に倒せるかと。
前の垢は良くも悪くも汎用性が高いので途中からキツい。

自分でしたら、アリスがいるアカウントに変えますね。ヘラも竜馬も使えますし。

ただ、今からエヴァコラボ運極目指すのには、新規アカウントはキツくないですか？

本当にコラボキャラ運極を作りたいなら、前のアカウントの方が作りやすいと思いますが。

エヴァコラボ制覇についてはとりあえず置いておきましょう。
まず、超絶攻略を踏まえて考えますと、フレ枠から１体借りるとして出撃枠を３体揃えなければいけません。
双方手持ちの内で、超絶適正枠は、

前垢（コルセア・桜木イブ・アラミス）
今垢（竜馬・アリス）などなどが目立ちますが（ほかにも一応存在はします）とりあえずのところイザナミ→クシナダ→毘沙門辺りまでは一気に集めたいところ・・・。
ガチャ産豊富なので、前垢の方が色々な降臨ように向いていますが、質は今垢の方が高いです。

進行度によって選択肢はわかれますが

①どちらも一応置いておく
②今垢置いて、サブでリセマラ再開
③前垢置いて、サブでリセマラ再開

で、②③を個人的にはお勧めします。
徹底無課金で進行すると仮定した場合、恐らくそのままどちらかで開始して続けると後悔して飽きます。それぐらい欲しいものに枯渇している。正直、ルシorアーサーはどちらかに欲しいところ・・・
きっちり育てていくorガチャ限に頼らないプレイスタイルを貫く・楽しむならば、どちらでも楽しめます。