こうなるの??

仕様です。レーザー系の友情は合計３本ほど射出されます。ロックオンレーザーはそれぞれ近くの「HPが０ではない」敵の中心に向かってレーザーをロックオンします。なので１回目や２回目の射出判定で敵のHPが０になれば、残りのレーザーで次に近い敵を狙います。

これを確認するのは爆発友情持ちにロックオンレーザー友情持ちでぶつかりに行ってみてください。動きながらだと何本か出てるのが確認できると思います。ちなみにショットガン（全方位ではないもの）でも途中で敵のHPが０になった場合、次に近い敵を狙います。

ついでなので豆知識（それなりにやってたら常識）をいっておくと、ロックオン衝撃波系のロックオンの相手はHPが低いもの（割合ではなく絶対値として）を狙います。

レーザーは大体は3本連続で放たれます。
なので、1本撃った時に敵を倒すと、残った2本は別の敵に狙いを定めるって訳です。
爆発でアトスの友発すると良く判ると思います。

ダメージが入る時と入らない時、ってのは良く判りませんね…。
敵が既に倒れていて当たり判定が消えてた、とかでしょうか…？

こんにちは‼
レーザー系は3本放射されますよ
ついでにですがエナサや爆発系(フレイムやフレイヤ)も3回放射されますよ‼

2本じゃなくて、実は3本です。24255×3が基本ダメージです。
これはワンウェイもエナサーも同じ

レーザーの友情コンボは基本的に３本放たれています。(ダンクレーザーを除く)
このことは爆発系の友情コンボを持つキャラにレーザー友情コンボ持ちのキャラを当てると３本出ていることが視覚的に分かりやすいと思います。

ダメージが入らないことについては恐らく、レーザーが当たる直前で敵を倒しきってしまったからではないかと思われます。

仕様も何もレーザーは基本的に3本発射されますよ?
1本に収束してますが狙った敵が死んだので次の敵に残った本数が発射され何本も発射された扱いになります
エナサーとかも3回発動してます

狙った対象のHPが０になったがレーザーはまだ発射されている状況の場合、直ぐ様次に近い敵をロックオンしてレーザーの起動が修正されるため２本に見えてるだけですよ。