モンストの回答詳細

ケータロス Lv36

自軍のHPがほとんど無かったのでは？

・神化のストライクショットは残りのHPの50%を消費し、消費したHP×50倍のダメージを与えるもの。HPが1~2万ほどのピンチな時には使っても、大ダメージを期待できない。

ウリエルの詳細ページから引っ張ってきた内容ですが、まさにこの状況に該当してたんでしょう。
神化ウリエルのＳＳはBOSS2からBOSS３にゲージをまたぐ時に使用するのがオススメです。自軍のHPが低ければあまり意味が無いですが、多めに残ってる際に使用すればBOSS3のゲージがある程度削れるくらい威力発揮できますので。

メテオだと両方に当てれば単純に２倍ダメージが出ますよ。なのでメテオ系が残ってるとわざと２体目を出すのも作戦の１つに入るかもしれませんね。ただ倒せなかった時に大ピンチになるので、諸刃の剣になりますが。