モンストの回答詳細

強弱の秤にかけることが無駄に思える組み合わせと思います。
錦織圭と白鳳のどちらが強いか、と聞いてるようなものです。

好みの話や、使い勝手の面を真面目に回答してみます。両方とも2体もちで、２体積みで使用する機会もありますので。デザインについては好みのレベルのため割愛します。

上杉謙信
プラス面
阿修羅最適
ダメージウォールメインの火降臨全般で最適
弱点往復による超高火力
遅延SSによる優秀な防御性能
マイナス面
重力バリアがあると、十分働けない
貫通で、友情が上下レーザーなため雑魚殲滅能力は高くない
２体積むと、意外にHPが低い。

火のクエストはダメージウォールも多いため比較的どこでも活躍できます。２体積みで阿修羅、ヴィシャス、スルトあたりに持って行くとバカみたいに働きます。とはいえ、火以外ではジャックくらいにしか使いません。特化型モンスターの代表格です。

ナナミ
プラス面
イザナミ適正(個人的には複数積みで最適)
サブ友情の闇短距離拡散弾による近距離攻撃力の高さ
メイン友情によるサソリ処理ほか雑魚殲滅能力の高さ
穴のないバランスのステータス
マイナス面
AGBのみのため、活躍できるクエストがテキーラナポレオンの２強とかぶる
使い方によっては火力がでないSS

謙信と違い、雑魚処理能力が高いことと、闇拡散弾のおかげで、木のクエスト以外の３枠目に非常に便利です。イザナミ戦も位置取り不要になり非常に安定します。

火のクエストに対する最強候補の謙信と、どこでも活躍の機会があるナナミでは、比べる必要性というのが結論です。