水属性の紋章

私なら、ノストラダムス神化ですね。

ノストラダムス神化は最近使うことが多いです。直近ではツクヨミ廻で活躍しました。ヒソカでも使えましたね。

また、スライドさせればアビリティ・適正が全然違うモンスターになるのでその点でも使い勝手がいいと思います。

ちなみにですが、私はノストラ進化につけてます。ゲルナンド２の適性がいなかったので紋章＋NP無効でクリアしました。カイン運極もまだなのでそこでも使おうと思ってます。

ラファエルも塔などで使う機会が多いですが、紋章を付けるほどではないかなという印象です。

どちらにも付けません。
理由はどちらも爆絶に使わないからです。
わたしはこゆき進化に付けてます。アルカディア用に火柱と速度ダウン、ゲルナンド３用に対火極（上とディアンヌに戦型か撃種加撃の特級（Ｍ？）でも可）とアビロックです。
特にゲルナンドは、これでPUWを踏まなくてもオオカミとワニが倒せるようになるので難易度がかなり違います。
使い終わったら、別に育てたこゆきに合成すれば、魂気の消費無く紋章が外せます。
回答になってないかもですが、ご参考まで。

紋章はなんとなく使いそうってキャラにつけるより明確な目的でつける方がいいかもです^^*
例えばラファエルはジューダス適正でジューダスで使うとして対火の心得つけても全く意味がないので。

キャラが好きだから付けるのであれば基本はその子をよく連れて行くクエストを考えて合っているスキルを付けてあげれば良いと思います。自己満足の域なのでアドバイスもし難いですが…一般的には対火・極や精神力・極が無難でしょうね。
しかしラファエルもノストラも火以外でも活躍するキャラなので（ラファは地雷回収に号令、回復。ダムスは光闇キラー持ち、スライドすれば火キラーでより属性特化に）一概に対火特化が良いとは言えません。
36階用にラファエルにHWマスター付けても他では回復なしがほとんどでほぼ活躍しませんし、最近はハートパネルやら類似ギミックもあるので人によっては付けない、勿体ない、ってなります(^_^;)

自分の場合は超爆適正の特に厄介なギミックを回避する為に紋章を使ってます。
例えばマグメルの友情コンボロック、アルカディアの速度ダウン、アルマゲドンの睡眠などはキャラのアビリティでは防げないので紋章で1体無効キャラが居るだけで難易度が全然変わって来ます(*´꒳`*)
アルフォンス？知らない子ですね！あの子はまだ接待来てないからセーフ…っ

聖域でヤマタケ零の比じゃないクソ痛いニードルパネルが登場するのでその面をクリアするためだけに紋章を付けたって話はよく聞きます。

モンストで様々なクエストにチャレンジしているとどうしても紋章の力を借りたいと思う場面が出てくると思うので、それまで温存でもいいと思いますよ〜！
なにせ魂気は一気には貯められないので(;´д｀)
紋章は急いで見た目で付けるものじゃなく、ちゃんと用途を考えて使った方が良いかなと感じているこの頃です（´-`）

私も迷っています。
(;´д｀)

質問主さんの判断基準が良く分かってないので自分だったらという点で回答しますねー。

自分なら
①強い・弱いとかはどうでもいい！こいつを出来るだけ使いたいんだ！
ってキャラの方につける。（※今回の場合２択でどちらか）

②周回したいクエストに良く連れて行くキャラ。

ですかね・・・要は、より好きなほうにつけることを考えて、それでも悩むなら実用性が高い方って感じですかね。

自分がダムスまだ未取得だからかもしれませんが、ラファエル・ダムスの２択なら※ラファエルに付けます。（※将来性を考えたらダムスの方がいいとは思ってますｗ）

自分も水紋章は、ラファエルかグィネヴィアの２択で悩みましたが、結局周回でよく使ったグィネヴィアに付けました。どちらも好きなんですけど対応ギミックが被ってなかったから割とすんなり決まりましたね・・・ｗ

迷うようならまだつけなくていいのでは？
個人的にはワンパンライン超えやノマダン周回など
何か明確な目的があるときにつける物という認識なので
付け替えにもポイント使いますし

つけるのであればダムス
ロック回避、不屈の闘力、火闇光の心得辺りですかね

このクエストをクリアしたい！みたいな特定のクエストクリアでは無く、満遍なく有利になれば良いなぁって事でしたらラファには対火の心得。
ノストラには対火光闇の心得で良いと思います。

楽にしたい、クリアしたいクエストによります。

紋章は付けたからといって圧倒的に楽になるようなものではないので（相互蘇生雑魚のワンパンライン超えるとかなら別）自分の好みで付けたらいいと思いますよ、ミスったと思ったら付け直せばいいんですし
基本的に対○の心得だと思いますが、他には36階用にラファに冷却付けるとかヨミ零用にノストラにHW付けるとかですかね
事故が減るだけですけど