書庫についての疑問です！

自分も難易度1つだけ残して書庫の消化をしていますが、クリア履歴リセット説の回答を見て血の気が引きました。

……が、どうやら公式に下記の文言があったので1つ残しで消化していって問題なさそうですね。

※Ver.10.0アップデートメンテナンス以前にクリアしたことがあるクエストでも、各クエストごとに1つのステージをクリアすることで、「初クリア報酬」をもらうことができます。

ただ、進化神化両方運極にした激究極をまたクリアしないといけないのは面倒ですね。

以前超絶・爆絶に初クリア報酬が追加されたときも全てリセットされて未クリアになったので今回もそうなるんじゃないですかね？

余ったスタミナでクリアしていくのは効率は良いのですが数が多いで300も回収する前に挫折しそうですね。
計算すると現在超絶3、激究極14、究極146、イベント184
究極が各２つ、イベントが3つ難易度があります。
全部合わせると818のクエストをクリアするとオーブが347個手に入れます。
1日1つのクエストを終わせれば1年掛かりませんね。
気が遠くなりそうですね…

残念ながらクリア履歴はリセットされるはずです。

過去の例だとまだ記憶に新しいところだと、超絶・爆絶の初回クリアドロップ確定がされた際には初クリア報酬のリセットされ、クリアしていない状態に成りました。
古いところだとギガマンティス、ヴィシャス、ダヴィンチに上級が追加されたさいにクリア履歴は全てリセットされました。
なので1つだけ残しておいても意味がないですよ。

確かノマクエに報酬付いた時がそうだったので、その説明ならそうなんでしょうけど...

今やるか先にやるかだけで効率は変わらないかと... 逆に別のクエストをつまみ食いしていく方が面倒な気がします。まあ誰も分からないことなので待ってみたらいかがでしょうか。

説明に書いてあるならできるんではないでしょうか？
運営に直接聞いてみてはいかがですか？