運極達成数

公式サイトを見てもらうと分かると思うのですが、「『運極達成数』は、合成素材に運極を達成しているモンスターが含まれていた場合には、含まれている運極モンスターの体数分、マイナスカウントされます」と記載されています(Ver.5.1より)。
つまり、運極モンスターを間違って合成素材にしてしまうと『運極達成数』は減ってしまいます。
売却した場合も当然『運極達成数』は減ってしまいます。
残念ながらバグではございません。
もう一度集め直すしかないですね…。

運極達成数は減りますよ！
今日自分もそうなりました！
そして一つ新しいことに気付きました( ^ω^ )

ちょうどダクドラが今日二体目出来上がり運極30体になりハクアもらいましが、
ダクドラにワクワク喰わせるために合成させるたら運極達成数が29に減り、
ミッション確認したら次もハクア貰えるみたいですU^ェ^U

運極キャラを売ったり合成に使ってボックス内からいなくならせると、運極所持数もそれに応じて減ってしまいます…

売ったり、合成したら、ボックスいなくなりますので、当然減ります。
ラックボーナスが無かった時はそうでしたら、現在はボックスにある運極の数でカウントされます。

ボックス以内運極はカウントされませんので、合成、販売したら当然へります。

それはショックですね。
うっかり売却したか素材として合成してしまったのかもしれませんね。

戻る可能性は低いかもしれませんが運営に問い合わせてみてはどうでしょう？
運極を作る労力はとても大きく、しかも火ノエルは期間限定でもう運極にすることができません。
正直に、誤って売却か合成してしまったかもしれないことを言えば戻してくれるかもしれません。

バックアップを取らずに初期化してしまって運営に問い合わせると戻してもらえることもあるようです。

最近では獣神化ゴッドストライクのわくわくの実特級を誤って削除してしまったときも運営に対処してもらえたようです。（これはシステムがわかりにくかったせいでもありますが）

あくまでも個人のミスなので戻る可能性は低いかもしれません。
ダメ元でやってみてください。

合成した場合は達成数が減ると記述されていますが
売却、引換時の記述はありません
ですのでこれらの場合は変わらないと思います

過去に引換えても減らなかったといっていた人もいました

ですので主さんの場合
売却ではなく合成してしまったんだと思います
残念なことに戻ってこないことに変わりないですが

http://www.monster-strike.com/news/20150914_2.html