モンストの回答詳細

Ace Lv24

できますよ。
バックアップは、XFLAG IDと端末IDで管理されているので、端末が変われば別のバックアップになります。
ただし、バックアップから戻せるのは、最後に取った端末のものだけで、それ以前に取ったバックアップは、すべて破棄される仕様です。

単純に、機種変更だけしたい、という時なら、2アカ運用中でも、1つのXFLAG IDだけで大丈夫ですが、もし万が一に備えて、だったら、それぞれ別のXFLAG IDをご用意なさるのがよろしいかと思います。