質問2つ

ひとつめ：出来ますね。酒呑童子を運極1と神化用確保したら全部カウントされました。今２体目+αでカウント205です。

ふたつめ：バージョンアップからの不具合です。公式からの情報は不明。無いと思う。
同時に２つ以上のアカが入るとどちらかか、その両方が完全に入れて無い状況になります。メインではわかりませんが、不具合が発生しているアカで空白が出来ます。
入り直しすれば直りますが野良だと絶望です。
なうしろの公開野良マルチでも見られてます。

2つ目のことにはなりますが、１０月３０日にTwitterで運営がそのことに対して反応していますね。
EXが出た時に発生すると恐ろしい。

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①説明書には3種類を運極にせよとは表記されていないので
降臨キャラ3種を全部運極にするか、1種のキャラを3体運極にすれば良いと思います。

②私はLINEでサブとやり取りしてるので
そういう事は無いです

２は最近騒がれてる不具合です。公式でも声明が出てました。

対応中なので、こちらで気を付けるしか方法はありません。

どうやらマルチでほぼ同じようなタイミングでクエストに入った場合、クエスト開始しても一部のゲストが取り残される状態が発生するようです。

自演マルチでしたら、クエスト開始ボタンを押す前に、すべての垢でちゃんと入室できてるか確認してください。ホストの画面ではきちんと入室できててもゲスト画面では入れてないとかざらにあります。

そうなった場合は、きちんと入室できてない垢を再度入室させてください。そうすることで防げます。

ただ、野良マルチでは相手の画面確認できないので防ぎようがないです。