モンストの回答詳細

まず、ルパン使用者で最後の最後までSSを撃たないのは、高確率で雑魚です。
使うタイミングは降臨により色々ですが、クイバタならボス2ゲージ目後半くらいで串に変身ですね。
最終ボスの地雷を回収するために地雷をまかれたタイミングで既に変身しておきたいです。

自身でソロ超絶で愛用しているのは阿修羅とヤマタケですが、阿修羅はボス戦直後にスサノオか関羽に変身すれば、最終でまた変身が間に合うので最終で変身できるタイミングで使ってます。
ヤマタケの方はルパン茨木ルシにフレ枠茨木とかでやってますが、その編成ならボス2か最終まで変身しないですね。
茨木をボス2の隙間に差し込んでルシの大号令で即突破してるので、ボス1で変身すると次の変身が間に合いませんから。
最終ゲージは茨木に変身してホーミング祭りで壊滅させ、弱点に茨木のSS一発撃ち込めば勝利確定です。

ボス戦の長さを把握して、長期戦になりそうならボス開始直後に撃ち、最終まで短期決戦なら最後付近まで温存でしょうか。
あまりしないけど、マルチでルパンがいて適正ガチャ限使用なら、変身しそうなタイミングで自身のキャラを近づけて変身しやすくさせたりしてます。
ダメは補正無いので、SS使用時は変身することだけを考えて撃てばいいです。
変身したルパンが居る場合、本物が何Pか確認して正確に当てないといけません。
ルシに変身したつもりがルパンに変身とか、反射で雑念を持って撃ったらルシに変身するつもりがクイバタに変身とか、下手なルパン使いによくあります。

有効に使えれば、ソロやガチャ限混合マルチでは降臨キャラでトップクラスの強さを持っているキャラではあります。