ホーミングの違い

貫通ホーミング：合計4回当たって消えるホーミング。その間、多段ヒットする事もある為、総合的なダメージが高い。
ホーミング：1回当たって消える。

威力的に貫通ホーミングよりも通常のホーミングのほうが高く設定されているが、多段ヒットする為に総合的な威力は貫通ホーミングのほうが高くなる場合が高い。
逆に高威力になるのが通常のホーミング。これは貫通での多段ヒットに負けないようにするため。また、弾数も多くなる傾向がある。

大体貫通ホーミングは４～８に対してホーミングは８～１６と倍以上。(なお、弾数が異常なキャラが偶に居る。大体は威力調整が入ってます)

計算してみると超強ホーミングと貫通ホーミングでの差はヒット数くらいで総合的なダメージ量としては僅かだったりする。

これらで比較されるのはワールド(超強＋貫通)とアリス(貫通×２)。どちらが火力として高いの？と結構出る事がある。

結論からすると大体の方はホーミング＝サソリ処理として扱う場合が高いので貫通ホーミングのほうが優遇されてます。絶対に当たる友情という意味では同じです。

ホーミングがHIT数1回なのに対して貫通ホーミングは4HITします。

つまり一般的な貫通ホーミングである貫通ホーミング8は32HITな訳です。

トータル威力であれば超絶ホーミングの方が強いのに、超強貫通ホーミングのが評価されるのは、この貫通の性質により、弱点HITしやすいからと言われています。

ちなみに余談ですが、超強貫通ホーミングの威力は貫通ホーミングの1.4倍であり、砲撃型貫通ホーミングが実質超強貫通ホーミングと言われるのはこのためです。

貫通するかしないかの違いです
目標物があり、その間に雑魚がいた場合は貫通なら目標物までたどり着きダメージを与えられますが、普通のホーミングは貫通しないので雑魚にあたって弾は潰えます